Οι γονείς εχουν δικαίωμα να υποβάλλουν αιτηση απαλλαγής των παιδιών τους από το μάθημα των θρησκευτικών. Αυτό γίνεται με απλή αίτηση στο σχολείο μέχρι τις 19 Σεπτεμβρίου κα ιη αίτηση σύμφωνα με την ισχύουσα εγκύκλιο θα πρέπει να αναφέρει "για λόγους θρησκευτικής συνείδησης".
Στο παρακάτω γράφημα, βλέπουμε πόσοι μαθητές ζητούν απαλλαγή από τα θρησκευτικά τα τελευταία χρόνια.
Πριν το 2015 η απαλλαγή γινόταν με απλή επίκληση "λόγων συνείδησης", όπως δηλαδή θεωρεί ορθό να γίνεται η Αρχή Προστασίας Δεδομένων. Το τελευταίο έτος που ίσχυσε αυτό είχαμε 12.030 απαλλαγές μαθητών.
Η εφαρμογή της εγκυκλίου Λοβέρδου από το 2016 που εφαρμόστηκε για πρώτη φορά και τηρήθηκε απαρέγκλιτα από τον ΣΥΡΙΖΑ οδήγησε σε μια σημαντική πτώση των απαλλαγών από το μάθημα (10.572), κάτι που χειροτέρεψε το 2017 (10.460) και το 2018 (10.144, το ιστορικά χαμηλό! ) και ανασχέθηκε το 2019 (10.670), όταν κερδίσαμε την απόφαση στο Ευρωπαϊκό Δικαστήριο, οπότε αφαιρέθηκε η δήλωση "δεν είναι Χ.Ο." για τον μαθητή που θα έπαιρνε απαλλαγή.
Αυτό οδήγησε σε μια σχετική αύξηση των απαλλαγών, καθώς οι επιθυμούντες την απαλλαγή υποβάλουν την αίτηση "για λόγους θρησκευτικής συνείδησης", δηλαδή το ίδιο πράγμα αλλά δεν λένε ευθέως ότι δεν είναι Χ.Ο.